这句诗“愁因薄暮起，兴是清秋发”出自唐代诗人孟浩然的《秋登兰山寄张五》。在这句诗中，“薄暮”指的是傍晚时分，而“清秋”则是指秋天的清爽。这两句诗描绘了诗人在傍晚时分感到愁绪，而在秋天清爽的气候中又激发出诗兴。

在这句诗中，暗藏的生肖动物是“鸡”。具体来说，可以从以下几个方面来解释：

从字面上来看，“薄暮”中的“暮”字与“鸡”的发音相似。在古代汉语中，“暮”字的发音与“鸡”字的发音相近，因此可以从字音上联想到鸡。

从文化寓意上来看，鸡在传统文化中具有特殊的象征意义。鸡在古代被称为“金鸡”，代表着吉祥、美好和长寿。在《山海经》中，鸡被描述为一种神鸟，具有神奇的力量。鸡在十二生肖中排名第十，与秋季相对应。从文化寓意上也可以将鸡与这句诗联系起来。

从诗句的意境来看，傍晚时分与鸡的作息时间相吻合。鸡在傍晚时分开始打鸣，预示着夜晚的到来。而诗人在傍晚时分感到愁绪，与鸡的作息时间形成了一种对比。这种对比使得鸡成为了这句诗中暗藏的生肖动物。

从诗句的韵律来看，这句诗的韵脚为“起、发”，与鸡的发音相近。在古代汉语中，诗歌的韵脚往往与生肖动物的发音有一定的关联。从韵律上也可以将鸡与这句诗联系起来。

这句诗“愁因薄暮起，兴是清秋发”中暗藏的生肖动物是“鸡”。这句诗通过描绘傍晚时分和秋天清爽的气候，以及鸡的作息时间、文化寓意和韵律特点，巧妙地将鸡融入其中，使得诗句更具意境和韵味。